Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2DO15399 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2DO15399 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms