Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF1O15321 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM9SF1O15321 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF1O15321 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF1O15321 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF1O15321 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF1O15321 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF1O15321 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms