Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTLC2O15270 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC2O15270 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms