Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLK1O15075 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLK1O15075 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLK1O15075 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms