Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHOX2AO14813 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms