Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TXNDC9O14530 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TXNDC9O14530 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC9O14530 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms