Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM38O00635 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM38O00635 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms