Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP56O00567 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP56O00567 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP56O00567 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP56O00567 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP56O00567 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP56O00567 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP56O00567 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOP56O00567 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOP56O00567 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOP56O00567 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOP56O00567 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOP56O00567 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOP56O00567 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOP56O00567 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP56O00567 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP56O00567 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP56O00567 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP56O00567 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP56O00567 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOP56O00567 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOP56O00567 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOP56O00567 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP56O00567 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP56O00567 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOP56O00567 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms