Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KPNA3O00505 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms