Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF10AO00220 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFRSF10AO00220 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms