Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM22K7EJ46 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms