Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
I3L3M4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
I3L3M4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
I3L3M4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
I3L3M4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
I3L3M4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
I3L3M4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
I3L3M4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
I3L3M4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
I3L3M4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
I3L3M4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
I3L3M4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
I3L3M4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
I3L3M4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms