Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H7C1H1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H7C1H1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H7C1H1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H7C1H1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H7C1H1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H7C1H1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms