Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3BML4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3BML4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H3BML4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H3BML4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H3BML4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H3BML4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H3BML4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H3BML4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H3BML4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H3BML4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H3BML4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H3BML4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H3BML4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms