Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms