Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRRT4C9JH25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRRT4C9JH25 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRRT4C9JH25 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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