Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ISM1B1AKI9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ISM1B1AKI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms