Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MV72 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MV72 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MV72 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MV72 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A8MV72 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A8MV72 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A8MV72 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A8MV72 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A8MV72 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A8MV72 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MV72 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MV72 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MV72 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MV72 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MV72 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MV72 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MV72 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MV72 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MV72 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MV72 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MV72 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MV72 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MV72 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MV72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms