Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRRM3A6NNA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRRM3A6NNA2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms