Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDR42E2A6NKP2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms