Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB15A6NHN6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB15A6NHN6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms