Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF316A6NFI3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF316A6NFI3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms