Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOLGA6CA6NDK9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms