Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms