Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XIRP2A4UGR9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XIRP2A4UGR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms