Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRAMEF27A3QJZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRAMEF27A3QJZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRAMEF27A3QJZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms