Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLRN2A0PK11 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLRN2A0PK11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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