Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms