Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms