Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms