Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms