Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms