Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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