Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NELL2Q99435 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms