Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms