Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms