Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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