Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms