Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMAD3P84022 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms