Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms