Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms