Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CXCR5P32302 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CXCR5P32302 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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