Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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