Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EPCAMP16422 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms