Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms