Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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