Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PACSIN2Q9UNF0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PACSIN2Q9UNF0 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms