Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNTNAP2Q9UHC6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNTNAP2Q9UHC6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms