Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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