Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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